מקדש ארכטאון (או ארכטאון) נקרא על שמו של ארכטאוס, הגיבור המיתולוגי ומלך אתונה שייסד את העיר. בשיריו האפיים של הומרוס, ארכתאוס היה בנם של הפיסטוס וגאיה, שגדלו במקדש אתנה דאז על האקרופוליס.
לפי המיתולוגיה היוונית, ארכתאוס הוא שקרא לאתונה על שם האלה אתנה ושינה את שמות תושביה ל"אתונאים", שעד אז נקראו "קקרופידס" (או קקרופידס). מיד לאחר מכן, הוא ייסד מקדש המוקדש לאלת החוכמה והציג את פולחן שלה באטיקה, שהגיע לשיאו בפסטיבל פנאתנאיה השנתי.
כמייסד המיתולוגי של אתונה, ארכתאוס היה אישיות נערצת מאוד, עם הישגיו היוו השראה לאמנים, משוררים ודרמטאים בעת העתיקה. האמינו כי המלך הגיבור הקדום נקבר מתחת ליסודות מקדש ארכטיון, בפינה הצפון-מערבית.
במיתולוגיה היוונית, אלת החוכמה אתנה ואל הימים פוסידון התחרו שניהם על חסותה של העיר שהייתה אמורה להפוך לאתונה. זאוס חשש מעימות שיפרוץ בין שני האלים האולימפיים, ולכן הוחלט שכל אחד מהם יציע מתנה לאתונאים, שיעשו את הבחירה האולטימטיבית.
פוסידון הלך ראשון, כשאל הימים מכה את הטריידנט שלו על גבעת האקרופוליס ומים זורמים מהאדמה. המים, לעומת זאת, היו מלוחים והאתונאים לא התרשמו, שכן לעיר כבר הייתה גישה לנהרות ולים.
אתנה ואחריה שתילת זרע באדמה ותוך רגעים, עץ זית מפואר בצבץ מתוך האדמה. ללא היסוס, העם בחר את מנחתה של אתנה, על העצים והפירות שלה. עץ הזית נטוע באותה נקודה שבה אומרים כי אתנה ניתנה מתנתה לאתונאים.
